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検査の流れ

「ふじのくにHOPEオンコパネル」専用ウェブサイトを用いて、「検査依頼」・「解析指示」・「解析結果の取得」などを行います。

※解析結果として、「解析結果レポート」・「二次的所見」・「参考情報」のPDFファイルの他にVCFファイルなどを取得することができます。

検査の流れ

専用ウェブサイトでできること

  • 検査依頼
  • 依頼書の作成・印刷
  • 検査の進捗確認
  • 遺伝子変異情報ファイルの確認
  • 解析指示
  • 解析結果の取得・閲覧・印刷
  • 添付文書の確認
  • 問い合わせ連絡先の確認

検査受託施設へ到着後の検査の流れ

ご提出いただいた検体が、検査受託施設へ到着した後の検査の流れです。

医療機関 検査説明・同意説明・同意取得
検体確認・検体採取
検体の準備
血液検体 1本、腫瘍組織(FFPEスライド) 5枚以上、HE染色スライド 1枚
※詳細は、「検体作製・提出」参照
専用ウェブサイトでご依頼
検査依頼・依頼書の印刷、C-CAT IDリストの印刷
検査受託
施設
検体及び依頼内容の確認
検体と依頼情報の照合  検体採取日、腫瘍含有率、検体に破損が無いか等の確認
検体及び依頼内容の確認
DNA抽出
判定項目・基準値

DNA濃度:
10 ng/μL以上
吸光度比(A260/A280):
1.6~2.5
DIN:
2.0超(FFPE検体のみ)
DNA抽出
DNAライブラリー作製、シークエンス
判定項目・基準値

DNAライブラリーサイズ
200~500 bp
On-target率
70%以上
DNAライブラリー濃度
1000 pM以上
Uniformity
90%以上
平均配列解析深度
500以上
Q30
85%以上
配列解析深度
95%以上
検体ペアのSNP一致率
80%以上
DNAライブラリー作製、シークエンス
医療機関 専用ウェブサイトで解析指示 専用ウェブサイトで解析指示
検査受託
施設
解析、解析結果レポートの生成

専用ウェブサイト上で解析指示が行われると、解析が実行されます。
解析完了後、検出された遺伝子変異等が記載された解析結果レポートが生成されます。
解析結果レポートは専用ウェブサイトで閲覧、印刷可能です。

ダウンロードファイルについて

解析結果一式はZIPファイルとしてダウンロードいただけます。

ZIPファイル
ZIPファイル
報告書PDFファイル
報告書PDFファイル
解析結果テキストファイル
解析結果テキストファイル

  • TMB
  • MSI
  • 薬物代謝酵素関連遺伝子多型
CATSフォーマットJSONファイル
CATSフォーマットJSONファイル
VCFファイル格納フォルダ
VCFファイル格納フォルダ

変異検出結果VCFファイル

  • 塩基置換、挿入・欠失
  • 融合遺伝子
  • コピー数変化
  • 生殖細胞系列バリアント
  • 薬物代謝酵素関連多型

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